Доста късен отговор, но за другите, които търсят отговор на тоя въпрос:
Просто си копираш папката (и връщаш обратно после - презаписваш отгоре, с изключен в този момент Скайп)
C:\Documents and Settings\твоят юзър\Application Data\Skype\твоят скайп юзър