В уиндоус има administrator в линукс има root. Това са административни потребители имащи пълни права върху операционната ситема. Докато болшинството от уиндоус потребителите работят с административни потребители вирусите ще имат някакъв шанс. Ще дам един прост пример - за да си осигури стартиране и за в бъдеще вируса има нужда да се запише в registry, да си сложи сървис или драйвър. Ако потребителя е администратор вируса се стартира с пълни права и системата е негова Ако обаче някой си е дал зора да зададе добре права и всички са обикновени потребители - вируса е ограничен единствено до папките до които има права сгафилия потребител. В този случай и антивирусната има къде къде по-голям шанс да се разправи с натрапника, защото тя е защитена от системата и има по-големи привилегии от потребителя стартирал вируса. Едва във Виста наблюдавам стремеж да се ограничат софтуерите и потребителите от работа с административни акаунти, което е добре

В линукс открай време се пипа с root само ако е нужно. Командите изпълнени под този потребител може да са разрушителни и затова линукс потребителите доста повече внимават.

В линукс понякога има проблеми с неща, които уиндоус потребителите са свикнали да са безпроблемни. Като пример ще дам драйвърите за някой устройства, flash плеъра и други. Това се получава за жалост точно заради по-малката популярност. Повечето фирми дават по-голям приоритет на уиндоус разработките. Едно добро изключение са NVIDIA, които за разлика от ATI имат добри и работещи драйвери.