Микропенисът е термин, използван от лекарите за обозначаване на много малък и недоразвит пенис. За поставянето на такава диагноза индивидът трябва да има: мъжки кариотип (46,XY); тестисите трябва да са развити или недоразвити; отворът на уретъра да е на върха на пениса и размирите на пениса да са под обичайните за етапа на развитие на индивида.